Nei sistemi con dispositivi di massa multipli (per esempio quelli con più dischi rigidi), il processo d'installazione di Fedora 13 differisce dalle precedenti versioni. Nella prima fase dell'installazione, anaconda chiede di selezionare il dispositivo da usare per l'installazione. I dispositivi che non vengono selezionati sono così esclusi dalla fase di partizionamento che ha luogo successivamente.