В состав Fedora 13 включена библиотека баз данных Berkeley db4 версии 4.8.26. Этот выпуск обладает повышенной производительностью, а также снабжен инструментом db_sql и дополнительными API.

mysql обновлена до 5.1.44 (с версии 5.1.39). Эта версия включает в себя новые возможности репликации. Дополнительные сведения смотрите в замечаниях к выпуску MySQL на http://lists.mysql.com/announce/664, http://lists.mysql.com/announce/660, http://lists.mysql.com/announce/654, http://lists.mysql.com/announce/645 и http://lists.mysql.com/announce/639.

postgresql обновлен до 8.4.2. Хотя в этом выпуске главным образом устранены ошибки, после обновления следует ПЕРЕСТРОИТЬ индексы таблиц (дамп не требуется), если имеются хеш-индексы. Полный список исправленных ошибок см. на http://www.postgresql.org/docs/8.4/static/release-8-4-2.html.

В выпуске Fedora 13 sqlite обновлена с 3.6.17 до 3.6.23. В эту версию внесен ряд новых прагм и функций и большое число исправлений. Полный список изменений см. на http://www.sqlite.org/changes.html.