До складу Fedora 13 включено версію 4.8.26 бази даних Berkeley db4. У цьому випуску покращено швидкодію, доданого новий інструмент db_sql та додаткові програмні інтерфейси (API).

mysql було оновлено до версії 5.1.44 (з версії 5.1.39). У цьому випуску додано нову можливість відтворення баз даних (реплікації). Щоб дізнатися більше, зверніться до нотаток щодо випуску MySQL за адресами http://lists.mysql.com/announce/664, http://lists.mysql.com/announce/660, http://lists.mysql.com/announce/654, http://lists.mysql.com/announce/645 і http://lists.mysql.com/announce/639.

postgresql було оновлено до версії 8.4.2. Хоча таке оновлення передусім пов’язане з усуванням вад, якщо у ваших таблицях є хешовані покажчики, вам слід виконати для цих таблиць REINDEX після оновлення (створення дампів непотрібне). Повний список виправлень вад можна знайти за адресою http://www.postgresql.org/docs/8.4/static/release-8-4-2.html.

Для Fedora 13, sqlite було оновлено з версії 3.6.17 до версії 3.6.23. У цьому випуску додано декілька нових вказівок і функцій, а також багато виправлень вад. Зверніться до сторінки http://www.sqlite.org/changes.html, щоб ознайомитися з повним списком змін.